Все последствия медикаментозного прерывания беременности можно разделить на ранние (или экстренные осложнения), возникающие в первые несколько суток после приема препарата, и поздние, имеющие место в отдаленном периоде времени (вплоть до нескольких лет). К экстренным осложнениям, безусловно, относится маточное кровотечение, которое без врачебной помощи может закончиться весьма печально (вот почему медикаментозный аборт должен производиться только в клиниках или больницах). Неприятным, но не угрожающим жизни непосредственно осложнением являются сильные, схваткообразные боли внизу живота. В принципе, они являются прямым следствием медикаментозного аборта, т.к. и мифепристон, и (особенно) мизопростол обладают свойством усиливать сокращения матки, что и провоцирует боль. При приеме препаратов внутрь изредка имеют место расстройства стула и спастические боли в кишечнике, т.к. все они обладают свойством усиливать сокращения гладкой мускулатуры кишки. Изредка (обычно при недостаточном обследовании пациентки) медикаментозный аборт проводится на фоне уже имеющихся воспалительных заболеваний матки, шейки матки, влагалища (эндометрит, цервицит, сальпингит, вагинит), иногда даже специфической (гонорейной, трихомонадной) этиологии. Это приводит к прогрессированию воспаления, которое до этого протекало скрыто, и появлению ярко выраженной картины воспалительного заболевания: возникают боли внизу живота, начинают беспокоить выделения из влагалища темного или зеленоватого цвета, порой с примесью гноя, лихорадка. Здесь уже лечение обязательно должно включать в себя антибактериальную терапию в условиях стационара. Иногда после аборта в полости матки остается плодное яйцо или его остатки, оболочки. Возникает состояние, называемое неполным абортом. Заподозрить его можно, если после аборта кровянистые выделения из влагалища не прекращаются длительное время. В этом случае не нужно пытаться исправить положение самостоятельно, например, принимая кровоостанавливающие препараты – эффект если и будет, то кратковременный. Самое верное решение здесь – обратиться к гинекологу и провести ультразвуковое исследование для установления истинной причины кровотечения, и если таковой является неотделившееся плодное яйцо, удалить его уже хирургическим способом – путем выскабливания полости матки.

Вторая группа включает в себя поздние последствия медикаментозного прерывания беременности. К ним относятся нарушение гормонального баланса из-за лекарственного поражения яичников, и  связанные с этим осложнения, самым важным из которых, безусловно, является бесплодие. Еще одно последствие медикаментозного аборта – нарушение менструального цикла – месячные становятся нерегулярными, обильными или, наоборот, скудными, иногда болезненными. Нередко при этом маточные кровотечения возникают в середине цикла, длятся 3-4 дня, а затем самопроизвольно прекращаются – женщина при этом не может отличить, менструальное ли это кровотечение или маточное – положение становится все более запутанным. После приема мифепристона повышается и риск возникновения опухолей тех органов, рост и развитие которых регулирует наша гормональная система (у женщин это молочные железы, яичники, тело матки, шейка матки). Повышение риска развития новообразований этих органов – одно из угрожающих жизни отдаленных последствий медикаментозного аборта.